《方舟：生存进化》安装在满是150多种不同生物的无人土地上，提供了几乎无穷无尽的内容。
虽然一开始这可能会让人不知所措，但玩家最终会建立一个关于方舟事实和传说的知识库。这可能包括已灭绝生物的全名及其饮食习惯。开发团队Studio Wildcard在方舟地图中添加了诸如凤凰、狮鹫之类的虚构生物，其中 90 多种生物均基于曾经是地球本土的动物。这些生物的行为经常被夸大以让玩家享受，例如 Doedicurus 的滚动运动和 Thylacoleo 攀爬垂直墙壁的能力，让人联想到蜘蛛侠，不知何故无视重力。
尽管有这些有趣的内容，玩家可以在游戏过程中收集到的生物都是真实存在着的。
早期的方舟围绕着一张名为 The Island 的地图展开，这是一片部分热带、部分冰冻的土地，是近 25 种历史上分类的恐龙、鸟类、哺乳动物和鱼类的家园。在探索岛屿时，玩家可能会偶然发现探索者笔记，这会导致他们获得 10 分钟的经验值提升。
找到所有探险家笔记后，玩家可以为他们的角色解锁额外的十个级别。
其中一些笔记是由岛屿探险家撰写的解释方舟传说的叙述，但其他笔记则具有更具教育意义的目的。后者被称为档案，其中包含由岛上的一位原始探险家：热情的古生物学家海伦娜·沃克 (Helena Walker) 撰写的潦草。这些提供了可以在那里找到的生物的简要描述。
《方舟：生存进化》笔记的描述包含有关该生物是食草动物、杂食动物、肉食动物还是鱼食动物的详细信息；它的全名；物种分类；以及它所处的地质时期。这个时间尺度的范围可以从三叠纪（与恐龙存在相关的最早时期）到今天的全新世（如琵琶鱼档案中所写）。
许多《方舟：生存进化》生物只能在它们的原生生物群落中找到，例如位于积雪中寒冷地区的猛犸象和毛犀牛。众所周知，这些现已灭绝的物种在冰河时代繁衍生息，因此在这种情况下设置是准确的。其他生物往往出现在对他们来说非常不自然的区域。
这方面的一个例子是《方舟：生存进化》中的巨型鳄鱼，据推测它是一种栖息在热带气候中的淡水爬行动物，但通常可以在方舟的冰冻海岸线的冰山中游泳。与夸张的行为一样，这可能更多是为了游戏中的乐趣，而不是科学准确性的失败尝试。
除了在每个档案底部写下的事实外，海伦娜还记录了该生物的行为，例如它的自卫能力。她进一步总结了这种生物在被驯服后可以被部落使用的程度，这纯属虚构。一旦发现，档案可以在玩家的库存中查看，就像探索生物学家的发现一样显示。
《方舟：生存进化》游戏内元素的性质可以教会玩家，其中许多人可能仅通过玩方舟就能够通过名称识别恐龙的图片。随着《方舟：生存进化》地图选择范围的扩大，其多样化的生物范围也在扩大；有些是虚构的，有些是模仿已灭绝的现实生物。随着这些生物中的大多数与他们自己独特的档案一起出现，玩家可以访问信息数据库，其中的内容可以通过游戏体验。