赛尔号大电影1古老的星际地图上面标记着精灵图鉴上所未知的精灵，吸引了小墨，并在机缘巧合之下成为了拯救赛尔号的英雄。罗杰船长为了寻找传说中的精灵，无意中发现了一艘全部漆成黑色的赛尔号，之后所有的战士包括传奇精灵“雷伊”和舰长罗杰都成为了海盗美利图的俘虏。
电影2宇宙海盗抓获了精灵迈尔斯，迈尔斯的求救惊动在赫尔卡星的雷伊，于是雷伊做出了反应前往幻影星。 蒙塔闯入赛尔号并意外的帮助赛小息赢得赛尔号精灵大师杯的选拔赛，赛小息决定和队友阿铁打、卡璐璐一起帮它救出爸爸，于是众人踏上寻找幻影星的旅程。
电影3宇宙中的纳斯星球，有一种神奇的果实，一直保护着整个纳斯星的生态平衡。星球上阿吉亚部落世世代代守护着神之树，在后来突然潜入的宇宙海盗肆意破坏，恰巧赛尔号先锋小队成员途经此地，加入了这场战斗。
电影4传说有一块魔石，能吸取天地能量。宇宙中有一位最好的工匠知道魔石总有一天会作恶，于是自己寻求克制魔石的方法。当魔石之战来临的时候，一只身着红色披风的精灵来到了SPT小队的面前。他们一行人踏上了更加危险的旅程。
电影5几经争战后，战神联盟在赫尔卡星建立“雷霆守护局”,守护星球子民。某天赫尔卡星出现了一位巨型来客，伤害无辜，企图摧毁城市。随后战神联盟火速集结，在调查幕后真凶的过程中，雷伊被奥古斯塔激发了体内的邪恶力量，陷入痛苦之中，终极一战之际，众战神召唤雷伊重新崛起，再次守护住了子民的平安。
电影6谱尼失踪后宇宙海盗变得活跃了起来。赛尔号船长重新召回赛尔先锋小队员执行找寻谱尼的艰巨任务，没想到这一消息让精灵捕手克拉卡获知，最后谱尼王者归来打败了克拉卡，赛尔小队也完成他们的使命。
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