针对不动产登记机构管理不规范和人员素质参差不齐的问题，相关部门应加强对工作人员的培训和指导，提高其业务水平和工作责任心。还要建立健全考核机制，对工作人员进行定期评估和考核，确保其符合岗位要求。对于涉嫌违法用地的案件，相关部门要加大执法力度，严格依法处理。要加强对违法用地行为的预防和打击力度，形成有效的震慑效应。在执法过程中，要注重保护当事人的合法权益，确保公平公正。
城市化进程的加速，土地资源日益紧张，土地管理问题逐渐凸显。一些不法分子为谋取私利，擅自占用、转让、出售土地，违法用地行为屡禁不止。这些违法行为不仅破坏了土地资源，还给社会带来了不稳定因素。为了维护土地管理秩序，保障公共利益，自然资源部决定严禁通过不动产登记将违法用地合法化。
自然资源部要求各级不动产登记机构在办理土地、房屋等不动产登记时，要严格遵守相关法律法规，对申请材料进行认真审核，防止不合法的登记行为。对于涉嫌违法用地的，应当及时向相关部门反映，配合开展调查处理。
自然资源部鼓励各级不动产登记机构与相关部门建立信息共享机制，及时获取土地使用情况、规划审批等信息。通过信息共享，可以更好地了解土地使用情况，发现并纠正违法用地行为，防止通过不动产登记将违法用地合法化。部分地区的不动产登记机构可能存在管理不规范、人员素质参差不齐等问题，需要加强管理和培训。由于历史原因或地区特殊情况，一些违法用地案件可能存在复杂性和争议性，需要相关部门加强沟通协调，确保政策落地生效。